Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
C18orf21Q32NC0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C18orf21Q32NC0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms