Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGCAQ16586 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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SGCAQ16586 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SGCAQ16586 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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