Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
RPE65Q16518 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPE65Q16518 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPE65Q16518 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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