Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDCD2Q16342 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCD2Q16342 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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