Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NTRK3Q16288 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
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