Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

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Length 812 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC41Q15345 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC41Q15345 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
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