Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

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Length 1,401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NCAPD2Q15021 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NCAPD2Q15021 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCAPD2Q15021 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCAPD2Q15021 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCAPD2Q15021 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCAPD2Q15021 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NCAPD2Q15021 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCAPD2Q15021 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCAPD2Q15021 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCAPD2Q15021 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
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