Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
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ERV3-1Q14264 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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ERV3-1Q14264 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ERV3-1Q14264 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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ERV3-1Q14264 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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ERV3-1Q14264 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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ERV3-1Q14264 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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ERV3-1Q14264 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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ERV3-1Q14264 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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ERV3-1Q14264 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERV3-1Q14264 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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