Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SCARF1Q14162 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCARF1Q14162 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
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