Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CNGB1Q14028 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CNGB1Q14028 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CNGB1Q14028 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
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