Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMED1Q13445 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMED1Q13445 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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