Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PLD1Q13393 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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PLD1Q13393 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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PLD1Q13393 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
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PLD1Q13393 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
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PLD1Q13393 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
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PLD1Q13393 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
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PLD1Q13393 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLD1Q13393 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
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