Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC38.71■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
PRDM2Q13029 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC38.68■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC38.67■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC38.65■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
PRDM2Q13029 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC38.6■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
PRDM2Q13029 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
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