Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPN13Q12923 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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