Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CPSF1Q10570 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CPSF1Q10570 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CPSF1Q10570 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
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