Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SMAGPQ0VAQ4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMAGPQ0VAQ4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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