Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RBBP4Q09028 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP4Q09028 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms