Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNB2Q08289 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CACNB2Q08289 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB2Q08289 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms