Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CXCL9Q07325 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CXCL9Q07325 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms