Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT17Q04695 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT17Q04695 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT17Q04695 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms