Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
XPCQ01831 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
XPCQ01831 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
XPCQ01831 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
XPCQ01831 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
XPCQ01831 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
XPCQ01831 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
XPCQ01831 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
XPCQ01831 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
XPCQ01831 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
XPCQ01831 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
XPCQ01831 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
XPCQ01831 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
XPCQ01831 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
XPCQ01831 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
XPCQ01831 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
XPCQ01831 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
XPCQ01831 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
XPCQ01831 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
XPCQ01831 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
XPCQ01831 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
XPCQ01831 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
XPCQ01831 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
XPCQ01831 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
XPCQ01831 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
XPCQ01831 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
XPCQ01831 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
XPCQ01831 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
XPCQ01831 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
XPCQ01831 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
XPCQ01831 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
XPCQ01831 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
XPCQ01831 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
XPCQ01831 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
XPCQ01831 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
XPCQ01831 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
XPCQ01831 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
XPCQ01831 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
XPCQ01831 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
XPCQ01831 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
XPCQ01831 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
XPCQ01831 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
XPCQ01831 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
XPCQ01831 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
XPCQ01831 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
XPCQ01831 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
XPCQ01831 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
XPCQ01831 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
XPCQ01831 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
XPCQ01831 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
XPCQ01831 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
XPCQ01831 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
XPCQ01831 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
XPCQ01831 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
XPCQ01831 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
XPCQ01831 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
XPCQ01831 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
XPCQ01831 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
XPCQ01831 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
XPCQ01831 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
XPCQ01831 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
XPCQ01831 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
XPCQ01831 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
XPCQ01831 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
XPCQ01831 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
XPCQ01831 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
XPCQ01831 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
XPCQ01831 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
XPCQ01831 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
XPCQ01831 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
XPCQ01831 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
XPCQ01831 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
XPCQ01831 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
XPCQ01831 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
XPCQ01831 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
XPCQ01831 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
XPCQ01831 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
XPCQ01831 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
XPCQ01831 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
XPCQ01831 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
XPCQ01831 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
XPCQ01831 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
XPCQ01831 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
XPCQ01831 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
XPCQ01831 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
XPCQ01831 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
XPCQ01831 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
XPCQ01831 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
XPCQ01831 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
XPCQ01831 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
XPCQ01831 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
XPCQ01831 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
XPCQ01831 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
XPCQ01831 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
XPCQ01831 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
XPCQ01831 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
XPCQ01831 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
XPCQ01831 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
XPCQ01831 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
XPCQ01831 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms