Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXC5Q00444 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC5Q00444 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXC5Q00444 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms