Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAMP2P63027 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAMP2P63027 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAMP2P63027 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP2P63027 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP2P63027 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP2P63027 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP2P63027 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP2P63027 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP2P63027 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP2P63027 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP2P63027 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP2P63027 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP2P63027 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP2P63027 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAMP2P63027 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP2P63027 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 364.3 ms