Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UFM1P61960 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UFM1P61960 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UFM1P61960 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UFM1P61960 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UFM1P61960 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UFM1P61960 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UFM1P61960 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UFM1P61960 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UFM1P61960 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFM1P61960 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFM1P61960 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFM1P61960 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFM1P61960 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFM1P61960 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFM1P61960 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFM1P61960 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFM1P61960 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFM1P61960 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFM1P61960 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFM1P61960 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFM1P61960 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFM1P61960 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFM1P61960 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFM1P61960 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFM1P61960 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFM1P61960 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFM1P61960 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFM1P61960 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFM1P61960 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFM1P61960 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFM1P61960 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFM1P61960 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFM1P61960 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFM1P61960 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFM1P61960 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFM1P61960 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFM1P61960 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFM1P61960 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFM1P61960 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UFM1P61960 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFM1P61960 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFM1P61960 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFM1P61960 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFM1P61960 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFM1P61960 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFM1P61960 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFM1P61960 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFM1P61960 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFM1P61960 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFM1P61960 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFM1P61960 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFM1P61960 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFM1P61960 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFM1P61960 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFM1P61960 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFM1P61960 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UFM1P61960 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFM1P61960 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFM1P61960 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFM1P61960 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFM1P61960 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFM1P61960 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFM1P61960 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UFM1P61960 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UFM1P61960 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UFM1P61960 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UFM1P61960 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UFM1P61960 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UFM1P61960 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UFM1P61960 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UFM1P61960 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
UFM1P61960 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UFM1P61960 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UFM1P61960 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UFM1P61960 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UFM1P61960 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UFM1P61960 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UFM1P61960 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UFM1P61960 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UFM1P61960 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UFM1P61960 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UFM1P61960 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UFM1P61960 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UFM1P61960 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UFM1P61960 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UFM1P61960 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UFM1P61960 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UFM1P61960 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UFM1P61960 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UFM1P61960 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UFM1P61960 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UFM1P61960 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UFM1P61960 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UFM1P61960 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UFM1P61960 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UFM1P61960 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UFM1P61960 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UFM1P61960 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UFM1P61960 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms