Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVFRD-1P60508 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFRD-1P60508 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms