Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPTEP56180 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPTEP56180 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPTEP56180 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPTEP56180 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPTEP56180 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPTEP56180 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPTEP56180 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPTEP56180 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPTEP56180 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPTEP56180 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TPTEP56180 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TPTEP56180 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPTEP56180 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPTEP56180 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPTEP56180 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPTEP56180 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPTEP56180 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPTEP56180 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPTEP56180 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPTEP56180 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPTEP56180 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPTEP56180 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPTEP56180 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPTEP56180 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPTEP56180 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPTEP56180 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPTEP56180 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPTEP56180 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPTEP56180 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPTEP56180 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPTEP56180 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPTEP56180 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPTEP56180 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPTEP56180 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPTEP56180 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPTEP56180 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPTEP56180 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPTEP56180 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPTEP56180 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPTEP56180 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPTEP56180 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPTEP56180 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPTEP56180 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPTEP56180 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPTEP56180 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPTEP56180 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPTEP56180 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPTEP56180 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPTEP56180 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPTEP56180 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPTEP56180 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPTEP56180 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPTEP56180 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPTEP56180 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPTEP56180 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TPTEP56180 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TPTEP56180 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPTEP56180 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPTEP56180 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPTEP56180 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPTEP56180 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPTEP56180 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPTEP56180 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPTEP56180 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPTEP56180 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPTEP56180 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPTEP56180 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPTEP56180 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPTEP56180 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPTEP56180 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPTEP56180 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPTEP56180 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPTEP56180 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPTEP56180 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPTEP56180 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPTEP56180 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPTEP56180 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPTEP56180 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TPTEP56180 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TPTEP56180 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPTEP56180 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPTEP56180 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPTEP56180 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPTEP56180 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPTEP56180 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPTEP56180 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPTEP56180 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPTEP56180 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPTEP56180 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPTEP56180 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPTEP56180 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPTEP56180 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPTEP56180 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPTEP56180 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPTEP56180 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPTEP56180 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPTEP56180 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPTEP56180 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPTEP56180 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms