Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BGRP55822 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BGRP55822 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BGRP55822 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BGRP55822 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BGRP55822 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SH3BGRP55822 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BGRP55822 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BGRP55822 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BGRP55822 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BGRP55822 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BGRP55822 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BGRP55822 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BGRP55822 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BGRP55822 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BGRP55822 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BGRP55822 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SH3BGRP55822 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3BGRP55822 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms