Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP9P55211 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP9P55211 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP9P55211 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP9P55211 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP9P55211 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP9P55211 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP9P55211 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP9P55211 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP9P55211 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP9P55211 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP9P55211 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP9P55211 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP9P55211 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP9P55211 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP9P55211 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP9P55211 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP9P55211 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP9P55211 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP9P55211 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP9P55211 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP9P55211 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP9P55211 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP9P55211 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP9P55211 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP9P55211 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP9P55211 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP9P55211 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP9P55211 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP9P55211 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP9P55211 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP9P55211 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP9P55211 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP9P55211 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP9P55211 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP9P55211 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP9P55211 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP9P55211 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP9P55211 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP9P55211 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP9P55211 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP9P55211 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP9P55211 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP9P55211 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP9P55211 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP9P55211 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP9P55211 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP9P55211 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP9P55211 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP9P55211 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP9P55211 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP9P55211 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP9P55211 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP9P55211 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP9P55211 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP9P55211 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP9P55211 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP9P55211 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP9P55211 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP9P55211 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP9P55211 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP9P55211 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP9P55211 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP9P55211 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP9P55211 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP9P55211 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP9P55211 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP9P55211 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP9P55211 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP9P55211 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP9P55211 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP9P55211 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP9P55211 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP9P55211 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP9P55211 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP9P55211 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP9P55211 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP9P55211 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP9P55211 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP9P55211 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP9P55211 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP9P55211 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP9P55211 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP9P55211 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP9P55211 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP9P55211 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP9P55211 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP9P55211 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP9P55211 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP9P55211 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP9P55211 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP9P55211 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP9P55211 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP9P55211 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP9P55211 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP9P55211 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP9P55211 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP9P55211 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CASP9P55211 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CASP9P55211 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms