Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AIF1P55008 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AIF1P55008 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AIF1P55008 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AIF1P55008 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AIF1P55008 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AIF1P55008 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AIF1P55008 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AIF1P55008 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AIF1P55008 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AIF1P55008 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AIF1P55008 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AIF1P55008 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AIF1P55008 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AIF1P55008 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AIF1P55008 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AIF1P55008 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AIF1P55008 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AIF1P55008 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AIF1P55008 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AIF1P55008 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AIF1P55008 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AIF1P55008 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AIF1P55008 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AIF1P55008 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AIF1P55008 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AIF1P55008 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AIF1P55008 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AIF1P55008 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AIF1P55008 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AIF1P55008 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AIF1P55008 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AIF1P55008 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AIF1P55008 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AIF1P55008 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AIF1P55008 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AIF1P55008 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AIF1P55008 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AIF1P55008 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AIF1P55008 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AIF1P55008 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AIF1P55008 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AIF1P55008 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AIF1P55008 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AIF1P55008 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AIF1P55008 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AIF1P55008 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AIF1P55008 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AIF1P55008 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AIF1P55008 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AIF1P55008 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AIF1P55008 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AIF1P55008 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AIF1P55008 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AIF1P55008 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AIF1P55008 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AIF1P55008 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AIF1P55008 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AIF1P55008 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AIF1P55008 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AIF1P55008 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AIF1P55008 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AIF1P55008 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AIF1P55008 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AIF1P55008 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AIF1P55008 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AIF1P55008 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AIF1P55008 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AIF1P55008 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AIF1P55008 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AIF1P55008 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AIF1P55008 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AIF1P55008 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AIF1P55008 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AIF1P55008 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AIF1P55008 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AIF1P55008 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AIF1P55008 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AIF1P55008 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AIF1P55008 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AIF1P55008 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AIF1P55008 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AIF1P55008 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AIF1P55008 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AIF1P55008 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AIF1P55008 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AIF1P55008 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AIF1P55008 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AIF1P55008 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AIF1P55008 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AIF1P55008 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AIF1P55008 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AIF1P55008 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AIF1P55008 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AIF1P55008 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AIF1P55008 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AIF1P55008 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AIF1P55008 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AIF1P55008 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AIF1P55008 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms