Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN1P54253 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATXN1P54253 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATXN1P54253 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms