Protein–RNA interactions for Protein: P51812

RPS6KA3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3P51812 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
RPS6KA3P51812 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS6KA3P51812 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms