Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNA2P51530 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNA2P51530 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNA2P51530 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNA2P51530 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNA2P51530 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNA2P51530 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNA2P51530 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNA2P51530 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNA2P51530 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNA2P51530 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNA2P51530 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNA2P51530 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DNA2P51530 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNA2P51530 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNA2P51530 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNA2P51530 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNA2P51530 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNA2P51530 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNA2P51530 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNA2P51530 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNA2P51530 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNA2P51530 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNA2P51530 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNA2P51530 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNA2P51530 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNA2P51530 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNA2P51530 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNA2P51530 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNA2P51530 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNA2P51530 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNA2P51530 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNA2P51530 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNA2P51530 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNA2P51530 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNA2P51530 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNA2P51530 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNA2P51530 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNA2P51530 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNA2P51530 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DNA2P51530 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DNA2P51530 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNA2P51530 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNA2P51530 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNA2P51530 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNA2P51530 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNA2P51530 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DNA2P51530 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNA2P51530 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNA2P51530 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNA2P51530 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNA2P51530 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNA2P51530 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNA2P51530 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNA2P51530 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DNA2P51530 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNA2P51530 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DNA2P51530 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNA2P51530 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNA2P51530 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNA2P51530 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNA2P51530 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNA2P51530 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNA2P51530 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNA2P51530 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNA2P51530 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNA2P51530 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNA2P51530 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNA2P51530 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNA2P51530 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNA2P51530 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNA2P51530 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNA2P51530 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNA2P51530 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNA2P51530 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNA2P51530 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNA2P51530 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNA2P51530 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNA2P51530 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DNA2P51530 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DNA2P51530 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNA2P51530 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNA2P51530 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNA2P51530 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNA2P51530 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNA2P51530 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNA2P51530 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNA2P51530 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNA2P51530 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNA2P51530 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNA2P51530 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNA2P51530 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNA2P51530 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNA2P51530 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNA2P51530 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNA2P51530 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNA2P51530 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNA2P51530 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNA2P51530 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNA2P51530 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms