Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
POLD2P49005 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
POLD2P49005 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD2P49005 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD2P49005 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD2P49005 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD2P49005 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD2P49005 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD2P49005 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD2P49005 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD2P49005 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD2P49005 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD2P49005 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLD2P49005 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD2P49005 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD2P49005 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD2P49005 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD2P49005 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD2P49005 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD2P49005 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD2P49005 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD2P49005 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD2P49005 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD2P49005 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD2P49005 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLD2P49005 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD2P49005 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD2P49005 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD2P49005 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLD2P49005 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLD2P49005 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLD2P49005 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLD2P49005 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLD2P49005 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLD2P49005 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD2P49005 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD2P49005 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD2P49005 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD2P49005 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD2P49005 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD2P49005 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD2P49005 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLD2P49005 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD2P49005 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD2P49005 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD2P49005 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD2P49005 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD2P49005 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD2P49005 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD2P49005 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD2P49005 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLD2P49005 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLD2P49005 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD2P49005 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD2P49005 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD2P49005 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD2P49005 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD2P49005 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD2P49005 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD2P49005 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD2P49005 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD2P49005 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD2P49005 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD2P49005 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD2P49005 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD2P49005 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD2P49005 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD2P49005 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD2P49005 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD2P49005 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD2P49005 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD2P49005 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD2P49005 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD2P49005 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD2P49005 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD2P49005 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD2P49005 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD2P49005 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD2P49005 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD2P49005 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD2P49005 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD2P49005 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD2P49005 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD2P49005 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD2P49005 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD2P49005 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD2P49005 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD2P49005 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD2P49005 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD2P49005 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD2P49005 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD2P49005 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD2P49005 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD2P49005 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD2P49005 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD2P49005 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD2P49005 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD2P49005 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD2P49005 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLD2P49005 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms