Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSSP48449 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSSP48449 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSSP48449 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSSP48449 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSSP48449 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSSP48449 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSSP48449 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LSSP48449 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSSP48449 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSSP48449 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LSSP48449 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LSSP48449 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSSP48449 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSSP48449 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSSP48449 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSSP48449 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSSP48449 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSSP48449 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSSP48449 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LSSP48449 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSSP48449 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSSP48449 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSSP48449 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSSP48449 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSSP48449 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSSP48449 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSSP48449 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSSP48449 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSSP48449 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSSP48449 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSSP48449 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LSSP48449 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LSSP48449 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSSP48449 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LSSP48449 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSSP48449 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSSP48449 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSSP48449 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSSP48449 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSSP48449 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSSP48449 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSSP48449 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LSSP48449 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSSP48449 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSSP48449 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSSP48449 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LSSP48449 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSSP48449 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSSP48449 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSSP48449 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSSP48449 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSSP48449 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSSP48449 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSSP48449 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LSSP48449 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LSSP48449 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LSSP48449 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LSSP48449 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LSSP48449 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LSSP48449 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSSP48449 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSSP48449 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSSP48449 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSSP48449 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSSP48449 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSSP48449 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSSP48449 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSSP48449 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSSP48449 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSSP48449 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSSP48449 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSSP48449 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSSP48449 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSSP48449 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LSSP48449 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSSP48449 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSSP48449 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSSP48449 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSSP48449 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSSP48449 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LSSP48449 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSSP48449 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSSP48449 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSSP48449 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSSP48449 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSSP48449 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LSSP48449 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSSP48449 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSSP48449 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSSP48449 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSSP48449 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSSP48449 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSSP48449 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LSSP48449 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSSP48449 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSSP48449 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSSP48449 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSSP48449 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LSSP48449 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms