Protein–RNA interactions for Protein: P43657

LPAR6, Lysophosphatidic acid receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR6P43657 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LPAR6P43657 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LPAR6P43657 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LPAR6P43657 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LPAR6P43657 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LPAR6P43657 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LPAR6P43657 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LPAR6P43657 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LPAR6P43657 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LPAR6P43657 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LPAR6P43657 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LPAR6P43657 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LPAR6P43657 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LPAR6P43657 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LPAR6P43657 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LPAR6P43657 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LPAR6P43657 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LPAR6P43657 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LPAR6P43657 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LPAR6P43657 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms