Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA3P43357 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA3P43357 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms