Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTRLP40313 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTRLP40313 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTRLP40313 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTRLP40313 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTRLP40313 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTRLP40313 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTRLP40313 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTRLP40313 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTRLP40313 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTRLP40313 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTRLP40313 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTRLP40313 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTRLP40313 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTRLP40313 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTRLP40313 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTRLP40313 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTRLP40313 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTRLP40313 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTRLP40313 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTRLP40313 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTRLP40313 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTRLP40313 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTRLP40313 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTRLP40313 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTRLP40313 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTRLP40313 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTRLP40313 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTRLP40313 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTRLP40313 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTRLP40313 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTRLP40313 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTRLP40313 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTRLP40313 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTRLP40313 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTRLP40313 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTRLP40313 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTRLP40313 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTRLP40313 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTRLP40313 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTRLP40313 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTRLP40313 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTRLP40313 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTRLP40313 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTRLP40313 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTRLP40313 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTRLP40313 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTRLP40313 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTRLP40313 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTRLP40313 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTRLP40313 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTRLP40313 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTRLP40313 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTRLP40313 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTRLP40313 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTRLP40313 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTRLP40313 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTRLP40313 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTRLP40313 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTRLP40313 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTRLP40313 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTRLP40313 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTRLP40313 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTRLP40313 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTRLP40313 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTRLP40313 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTRLP40313 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.7 ms