Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJC1P36383 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJC1P36383 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJC1P36383 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJC1P36383 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJC1P36383 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJC1P36383 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJC1P36383 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJC1P36383 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJC1P36383 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJC1P36383 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GJC1P36383 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJC1P36383 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJC1P36383 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GJC1P36383 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJC1P36383 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJC1P36383 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJC1P36383 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJC1P36383 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJC1P36383 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GJC1P36383 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJC1P36383 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJC1P36383 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJC1P36383 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJC1P36383 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJC1P36383 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJC1P36383 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJC1P36383 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJC1P36383 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJC1P36383 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJC1P36383 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GJC1P36383 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJC1P36383 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJC1P36383 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJC1P36383 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJC1P36383 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GJC1P36383 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GJC1P36383 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJC1P36383 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJC1P36383 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJC1P36383 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJC1P36383 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJC1P36383 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJC1P36383 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJC1P36383 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJC1P36383 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJC1P36383 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJC1P36383 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJC1P36383 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJC1P36383 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GJC1P36383 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GJC1P36383 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJC1P36383 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GJC1P36383 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJC1P36383 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJC1P36383 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJC1P36383 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJC1P36383 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJC1P36383 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJC1P36383 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJC1P36383 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJC1P36383 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GJC1P36383 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GJC1P36383 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJC1P36383 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GJC1P36383 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJC1P36383 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJC1P36383 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJC1P36383 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJC1P36383 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJC1P36383 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJC1P36383 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJC1P36383 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJC1P36383 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJC1P36383 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJC1P36383 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GJC1P36383 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJC1P36383 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJC1P36383 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJC1P36383 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJC1P36383 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJC1P36383 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJC1P36383 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJC1P36383 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GJC1P36383 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJC1P36383 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJC1P36383 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJC1P36383 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJC1P36383 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJC1P36383 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJC1P36383 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJC1P36383 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJC1P36383 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJC1P36383 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJC1P36383 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJC1P36383 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJC1P36383 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJC1P36383 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJC1P36383 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GJC1P36383 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms