Protein–RNA interactions for Protein: P31937

HIBADH, 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIBADHP31937 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HIBADHP31937 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HIBADHP31937 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIBADHP31937 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HIBADHP31937 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIBADHP31937 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIBADHP31937 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIBADHP31937 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIBADHP31937 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIBADHP31937 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIBADHP31937 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIBADHP31937 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIBADHP31937 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HIBADHP31937 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIBADHP31937 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIBADHP31937 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIBADHP31937 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIBADHP31937 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HIBADHP31937 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HIBADHP31937 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIBADHP31937 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIBADHP31937 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIBADHP31937 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HIBADHP31937 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HIBADHP31937 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HIBADHP31937 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HIBADHP31937 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HIBADHP31937 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HIBADHP31937 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HIBADHP31937 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms