Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALDH4A1P30038 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALDH4A1P30038 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms