Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNCP24863 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNCP24863 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNCP24863 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNCP24863 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNCP24863 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNCP24863 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNCP24863 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNCP24863 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNCP24863 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNCP24863 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNCP24863 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNCP24863 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNCP24863 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNCP24863 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNCP24863 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNCP24863 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNCP24863 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNCP24863 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNCP24863 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNCP24863 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNCP24863 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNCP24863 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNCP24863 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNCP24863 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNCP24863 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNCP24863 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNCP24863 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNCP24863 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNCP24863 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNCP24863 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNCP24863 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNCP24863 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNCP24863 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNCP24863 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNCP24863 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNCP24863 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNCP24863 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNCP24863 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNCP24863 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNCP24863 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNCP24863 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNCP24863 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNCP24863 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNCP24863 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNCP24863 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNCP24863 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNCP24863 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNCP24863 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNCP24863 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNCP24863 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNCP24863 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNCP24863 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNCP24863 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNCP24863 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNCP24863 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNCP24863 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNCP24863 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNCP24863 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNCP24863 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNCP24863 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNCP24863 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNCP24863 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNCP24863 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNCP24863 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNCP24863 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNCP24863 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNCP24863 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNCP24863 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNCP24863 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNCP24863 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNCP24863 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNCP24863 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNCP24863 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNCP24863 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNCP24863 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNCP24863 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNCP24863 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNCP24863 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNCP24863 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNCP24863 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNCP24863 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNCP24863 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCNCP24863 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNCP24863 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNCP24863 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNCP24863 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNCP24863 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNCP24863 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNCP24863 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNCP24863 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNCP24863 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNCP24863 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNCP24863 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNCP24863 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNCP24863 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNCP24863 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNCP24863 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNCP24863 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNCP24863 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms