Protein–RNA interactions for Protein: P23677

ITPKA, Inositol-trisphosphate 3-kinase A, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITPKAP23677 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITPKAP23677 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITPKAP23677 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms