Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TUBG1P23258 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms