Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EPHA1P21709 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms