Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCLP19338 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCLP19338 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCLP19338 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCLP19338 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCLP19338 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCLP19338 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCLP19338 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCLP19338 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCLP19338 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCLP19338 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NCLP19338 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NCLP19338 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCLP19338 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCLP19338 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCLP19338 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NCLP19338 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCLP19338 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCLP19338 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCLP19338 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NCLP19338 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCLP19338 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCLP19338 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCLP19338 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCLP19338 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCLP19338 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCLP19338 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCLP19338 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCLP19338 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCLP19338 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCLP19338 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCLP19338 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCLP19338 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NCLP19338 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NCLP19338 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCLP19338 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCLP19338 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCLP19338 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCLP19338 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NCLP19338 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCLP19338 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCLP19338 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCLP19338 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCLP19338 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCLP19338 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCLP19338 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCLP19338 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCLP19338 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCLP19338 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCLP19338 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCLP19338 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCLP19338 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCLP19338 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCLP19338 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCLP19338 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCLP19338 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCLP19338 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCLP19338 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCLP19338 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCLP19338 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCLP19338 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCLP19338 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCLP19338 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCLP19338 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCLP19338 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCLP19338 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCLP19338 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCLP19338 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCLP19338 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCLP19338 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCLP19338 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCLP19338 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCLP19338 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCLP19338 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCLP19338 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCLP19338 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCLP19338 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCLP19338 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NCLP19338 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCLP19338 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NCLP19338 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCLP19338 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCLP19338 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCLP19338 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCLP19338 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCLP19338 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCLP19338 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCLP19338 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCLP19338 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCLP19338 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCLP19338 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCLP19338 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCLP19338 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCLP19338 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCLP19338 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCLP19338 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCLP19338 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCLP19338 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCLP19338 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCLP19338 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms