Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGAM1P18669 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms