Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR1P18146 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR1P18146 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR1P18146 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR1P18146 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR1P18146 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR1P18146 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR1P18146 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR1P18146 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR1P18146 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EGR1P18146 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR1P18146 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR1P18146 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR1P18146 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR1P18146 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR1P18146 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR1P18146 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR1P18146 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR1P18146 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR1P18146 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR1P18146 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR1P18146 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR1P18146 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR1P18146 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR1P18146 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EGR1P18146 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR1P18146 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR1P18146 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR1P18146 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR1P18146 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR1P18146 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR1P18146 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR1P18146 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR1P18146 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR1P18146 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR1P18146 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR1P18146 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EGR1P18146 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR1P18146 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR1P18146 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR1P18146 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR1P18146 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR1P18146 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR1P18146 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR1P18146 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR1P18146 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR1P18146 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR1P18146 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR1P18146 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR1P18146 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EGR1P18146 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR1P18146 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR1P18146 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR1P18146 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR1P18146 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR1P18146 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR1P18146 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR1P18146 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR1P18146 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR1P18146 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR1P18146 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR1P18146 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR1P18146 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EGR1P18146 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR1P18146 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR1P18146 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR1P18146 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR1P18146 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR1P18146 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR1P18146 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR1P18146 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR1P18146 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR1P18146 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR1P18146 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR1P18146 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR1P18146 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR1P18146 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR1P18146 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EGR1P18146 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EGR1P18146 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EGR1P18146 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EGR1P18146 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EGR1P18146 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
EGR1P18146 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
EGR1P18146 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EGR1P18146 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EGR1P18146 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
EGR1P18146 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EGR1P18146 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EGR1P18146 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EGR1P18146 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EGR1P18146 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR1P18146 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR1P18146 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR1P18146 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR1P18146 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR1P18146 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR1P18146 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR1P18146 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR1P18146 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms