Protein–RNA interactions for Protein: P16035

TIMP2, Metalloproteinase inhibitor 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP2P16035 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP2P16035 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMP2P16035 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms