Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TCF4P15884 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TCF4P15884 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TCF4P15884 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF4P15884 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF4P15884 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF4P15884 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF4P15884 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF4P15884 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF4P15884 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF4P15884 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF4P15884 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF4P15884 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF4P15884 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF4P15884 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF4P15884 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF4P15884 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF4P15884 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF4P15884 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF4P15884 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF4P15884 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF4P15884 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF4P15884 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF4P15884 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF4P15884 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF4P15884 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF4P15884 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF4P15884 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF4P15884 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF4P15884 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF4P15884 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF4P15884 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF4P15884 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF4P15884 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF4P15884 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF4P15884 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF4P15884 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF4P15884 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF4P15884 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF4P15884 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF4P15884 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF4P15884 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF4P15884 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF4P15884 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF4P15884 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF4P15884 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF4P15884 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF4P15884 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF4P15884 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF4P15884 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF4P15884 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF4P15884 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF4P15884 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF4P15884 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF4P15884 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF4P15884 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF4P15884 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF4P15884 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF4P15884 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF4P15884 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF4P15884 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF4P15884 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF4P15884 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF4P15884 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF4P15884 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF4P15884 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF4P15884 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF4P15884 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF4P15884 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF4P15884 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF4P15884 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF4P15884 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF4P15884 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF4P15884 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF4P15884 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF4P15884 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF4P15884 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF4P15884 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF4P15884 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF4P15884 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF4P15884 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF4P15884 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF4P15884 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF4P15884 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF4P15884 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF4P15884 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF4P15884 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF4P15884 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF4P15884 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF4P15884 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF4P15884 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF4P15884 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF4P15884 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF4P15884 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF4P15884 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF4P15884 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF4P15884 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF4P15884 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF4P15884 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF4P15884 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms