Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNNT1P13805 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNNT1P13805 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms